Toimielimet ja päätöksenteko

Etelä-Pohjanmaan hyvinvointialueen ylintä päätösvaltaa käyttää aluevaltuusto, joka valitaan aluevaaleissa. Aluevaltuusto valitsee aluehallituksen. Lisäksi hyvinvointialueella on lautakuntia ja vaikuttamistoimielimiä.